O Audi Q3 foi eleito o melhor na categoria "Small Off-Road 4x4" pelo Parlamento Europeu de Defesa do Consumidor, uma iniciativa do Euro NCAP (New Car Assessment Program). O modelo recebeu cinco estrelas - a maior pontuação possível – por segurança passiva contra acidente.
A pontuação máxima de cinco estrelas foi obtida facilmente pelo Q3 por seu desempenho para a proteção do condutor e dos passageiros em colisões de impacto frontal e lateral. As crianças também são muito protegidas no novo Audi Q3. O Euro NCAP avaliou, entre outras coisas, o lembrete de cinto de segurança, e em particular os passageiros do banco traseiro. O Audi Q3 vem com ambos os sistemas.
Assegurar a proteção dos pedestres e ciclistas também é uma preocupação importante da Audi. A parte dianteira do veículo foi especialmente concebida para auxiliar neste quesito e atenuar as consequências de uma colisão.